Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim43aQ3TL54 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim43aQ3TL54 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim43aQ3TL54 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim43aQ3TL54 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim43aQ3TL54 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim43aQ3TL54 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim43aQ3TL54 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim43aQ3TL54 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim43aQ3TL54 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim43aQ3TL54 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim43aQ3TL54 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trim43aQ3TL54 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim43aQ3TL54 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim43aQ3TL54 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trim43aQ3TL54 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim43aQ3TL54 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim43aQ3TL54 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim43aQ3TL54 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trim43aQ3TL54 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim43aQ3TL54 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim43aQ3TL54 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim43aQ3TL54 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim43aQ3TL54 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim43aQ3TL54 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim43aQ3TL54 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trim43aQ3TL54 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim43aQ3TL54 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim43aQ3TL54 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim43aQ3TL54 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim43aQ3TL54 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trim43aQ3TL54 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim43aQ3TL54 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim43aQ3TL54 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Trim43aQ3TL54 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim43aQ3TL54 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim43aQ3TL54 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms