Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trappc13Q3TIR1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trappc13Q3TIR1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trappc13Q3TIR1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.6 ms