Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Zfp444Q3TDV8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zfp444Q3TDV8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Zfp444Q3TDV8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Zfp444Q3TDV8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Zfp444Q3TDV8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zfp444Q3TDV8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zfp444Q3TDV8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zfp444Q3TDV8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Zfp444Q3TDV8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zfp444Q3TDV8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zfp444Q3TDV8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Zfp444Q3TDV8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Zfp444Q3TDV8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zfp444Q3TDV8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zfp444Q3TDV8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zfp444Q3TDV8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zfp444Q3TDV8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zfp444Q3TDV8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zfp444Q3TDV8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Zfp444Q3TDV8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zfp444Q3TDV8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Zfp444Q3TDV8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zfp444Q3TDV8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zfp444Q3TDV8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zfp444Q3TDV8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Zfp444Q3TDV8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zfp444Q3TDV8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Zfp444Q3TDV8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zfp444Q3TDV8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zfp444Q3TDV8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zfp444Q3TDV8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zfp444Q3TDV8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Zfp444Q3TDV8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Zfp444Q3TDV8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zfp444Q3TDV8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Zfp444Q3TDV8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zfp444Q3TDV8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Zfp444Q3TDV8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zfp444Q3TDV8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zfp444Q3TDV8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zfp444Q3TDV8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zfp444Q3TDV8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zfp444Q3TDV8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Zfp444Q3TDV8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Zfp444Q3TDV8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Zfp444Q3TDV8 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zfp444Q3TDV8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zfp444Q3TDV8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zfp444Q3TDV8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Zfp444Q3TDV8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zfp444Q3TDV8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zfp444Q3TDV8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zfp444Q3TDV8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Zfp444Q3TDV8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zfp444Q3TDV8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zfp444Q3TDV8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zfp444Q3TDV8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Zfp444Q3TDV8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zfp444Q3TDV8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Zfp444Q3TDV8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zfp444Q3TDV8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zfp444Q3TDV8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zfp444Q3TDV8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Zfp444Q3TDV8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms