Protein–RNA interactions for Protein: Q2VIS4

Flg2, Filaggrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 2,362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flg2Q2VIS4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Flg2Q2VIS4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Flg2Q2VIS4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms