Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Specc1lQ2KN98 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Specc1lQ2KN98 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Specc1lQ2KN98 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Specc1lQ2KN98 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Specc1lQ2KN98 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Specc1lQ2KN98 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Specc1lQ2KN98 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Specc1lQ2KN98 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Specc1lQ2KN98 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Specc1lQ2KN98 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Specc1lQ2KN98 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Specc1lQ2KN98 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Specc1lQ2KN98 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Specc1lQ2KN98 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Specc1lQ2KN98 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Specc1lQ2KN98 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Specc1lQ2KN98 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Specc1lQ2KN98 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Specc1lQ2KN98 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Specc1lQ2KN98 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Specc1lQ2KN98 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Specc1lQ2KN98 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Specc1lQ2KN98 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Specc1lQ2KN98 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Specc1lQ2KN98 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Specc1lQ2KN98 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Specc1lQ2KN98 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Specc1lQ2KN98 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Specc1lQ2KN98 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Specc1lQ2KN98 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Specc1lQ2KN98 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Specc1lQ2KN98 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Specc1lQ2KN98 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Specc1lQ2KN98 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Specc1lQ2KN98 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Specc1lQ2KN98 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Specc1lQ2KN98 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Specc1lQ2KN98 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Specc1lQ2KN98 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Specc1lQ2KN98 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Specc1lQ2KN98 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Specc1lQ2KN98 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Specc1lQ2KN98 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Specc1lQ2KN98 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Specc1lQ2KN98 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Specc1lQ2KN98 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Specc1lQ2KN98 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Specc1lQ2KN98 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Specc1lQ2KN98 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Specc1lQ2KN98 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Specc1lQ2KN98 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Specc1lQ2KN98 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Specc1lQ2KN98 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Specc1lQ2KN98 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Specc1lQ2KN98 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms