Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rpusd3Q14AI6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpusd3Q14AI6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpusd3Q14AI6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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