Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF22

Ccdc138, Coiled-coil domain-containing protein 138, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc138Q0VF22 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc138Q0VF22 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccdc138Q0VF22 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccdc138Q0VF22 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccdc138Q0VF22 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms