Protein–RNA interactions for Protein: Q0P678

Zc3h18, Zinc finger CCCH domain-containing protein 18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 948 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zc3h18Q0P678 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zc3h18Q0P678 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zc3h18Q0P678 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zc3h18Q0P678 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zc3h18Q0P678 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms