Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Pate4Q09098 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pate4Q09098 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pate4Q09098 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms