Protein–RNA interactions for Protein: Q08775

Runx2, Runt-related transcription factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Runx2Q08775 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Runx2Q08775 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Runx2Q08775 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.2 ms