Protein–RNA interactions for Protein: Q08652

Rbp2, Retinol-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp2Q08652 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rbp2Q08652 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rbp2Q08652 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rbp2Q08652 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms