Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Col17a1Q07563 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Col17a1Q07563 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Col17a1Q07563 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Col17a1Q07563 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Col17a1Q07563 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Col17a1Q07563 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Col17a1Q07563 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Col17a1Q07563 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Col17a1Q07563 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Col17a1Q07563 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Col17a1Q07563 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Col17a1Q07563 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Col17a1Q07563 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Col17a1Q07563 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Col17a1Q07563 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Col17a1Q07563 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Col17a1Q07563 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Col17a1Q07563 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Col17a1Q07563 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Col17a1Q07563 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Col17a1Q07563 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Col17a1Q07563 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Col17a1Q07563 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Col17a1Q07563 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Col17a1Q07563 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Col17a1Q07563 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Col17a1Q07563 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Col17a1Q07563 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Col17a1Q07563 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Col17a1Q07563 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Col17a1Q07563 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Col17a1Q07563 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Col17a1Q07563 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Col17a1Q07563 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
Col17a1Q07563 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Col17a1Q07563 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Col17a1Q07563 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Col17a1Q07563 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Col17a1Q07563 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Col17a1Q07563 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Col17a1Q07563 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Col17a1Q07563 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Col17a1Q07563 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Col17a1Q07563 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Col17a1Q07563 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Col17a1Q07563 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Col17a1Q07563 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Col17a1Q07563 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Col17a1Q07563 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Col17a1Q07563 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Col17a1Q07563 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Col17a1Q07563 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Col17a1Q07563 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Col17a1Q07563 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Col17a1Q07563 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Col17a1Q07563 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Col17a1Q07563 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Col17a1Q07563 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
Col17a1Q07563 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Col17a1Q07563 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Col17a1Q07563 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Col17a1Q07563 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Col17a1Q07563 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Col17a1Q07563 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Col17a1Q07563 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Col17a1Q07563 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Col17a1Q07563 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
Col17a1Q07563 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Col17a1Q07563 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Col17a1Q07563 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Col17a1Q07563 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Col17a1Q07563 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Col17a1Q07563 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Col17a1Q07563 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Col17a1Q07563 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Col17a1Q07563 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Col17a1Q07563 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Col17a1Q07563 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Col17a1Q07563 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Col17a1Q07563 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
Col17a1Q07563 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Col17a1Q07563 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Col17a1Q07563 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Col17a1Q07563 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Col17a1Q07563 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Col17a1Q07563 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Col17a1Q07563 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Col17a1Q07563 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Col17a1Q07563 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Col17a1Q07563 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Col17a1Q07563 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Col17a1Q07563 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Col17a1Q07563 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Col17a1Q07563 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Col17a1Q07563 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Col17a1Q07563 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Col17a1Q07563 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Col17a1Q07563 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Col17a1Q07563 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms