Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Caprin2Q05A80 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Caprin2Q05A80 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Caprin2Q05A80 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Caprin2Q05A80 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Caprin2Q05A80 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Caprin2Q05A80 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Caprin2Q05A80 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Caprin2Q05A80 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Caprin2Q05A80 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Caprin2Q05A80 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Caprin2Q05A80 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Caprin2Q05A80 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Caprin2Q05A80 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Caprin2Q05A80 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Caprin2Q05A80 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Caprin2Q05A80 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Caprin2Q05A80 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Caprin2Q05A80 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Caprin2Q05A80 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Caprin2Q05A80 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Caprin2Q05A80 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Caprin2Q05A80 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Caprin2Q05A80 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Caprin2Q05A80 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Caprin2Q05A80 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Caprin2Q05A80 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Caprin2Q05A80 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Caprin2Q05A80 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Caprin2Q05A80 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Caprin2Q05A80 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Caprin2Q05A80 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Caprin2Q05A80 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Caprin2Q05A80 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Caprin2Q05A80 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Caprin2Q05A80 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Caprin2Q05A80 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Caprin2Q05A80 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Caprin2Q05A80 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Caprin2Q05A80 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Caprin2Q05A80 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Caprin2Q05A80 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Caprin2Q05A80 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Caprin2Q05A80 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Caprin2Q05A80 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Caprin2Q05A80 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Caprin2Q05A80 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Caprin2Q05A80 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Caprin2Q05A80 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms