Protein–RNA interactions for Protein: Q05A13

Sdr16c6, Short-chain dehydrogenase/reductase family 16C member 6, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdr16c6Q05A13 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdr16c6Q05A13 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdr16c6Q05A13 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdr16c6Q05A13 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdr16c6Q05A13 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdr16c6Q05A13 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sdr16c6Q05A13 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdr16c6Q05A13 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdr16c6Q05A13 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdr16c6Q05A13 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdr16c6Q05A13 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdr16c6Q05A13 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdr16c6Q05A13 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdr16c6Q05A13 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sdr16c6Q05A13 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdr16c6Q05A13 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdr16c6Q05A13 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdr16c6Q05A13 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdr16c6Q05A13 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdr16c6Q05A13 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sdr16c6Q05A13 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sdr16c6Q05A13 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sdr16c6Q05A13 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Sdr16c6Q05A13 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Sdr16c6Q05A13 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms