Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Top1Q04750 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Top1Q04750 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top1Q04750 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top1Q04750 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top1Q04750 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top1Q04750 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Top1Q04750 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top1Q04750 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Top1Q04750 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top1Q04750 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Top1Q04750 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top1Q04750 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top1Q04750 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top1Q04750 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Top1Q04750 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top1Q04750 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top1Q04750 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top1Q04750 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top1Q04750 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Top1Q04750 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top1Q04750 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top1Q04750 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Top1Q04750 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top1Q04750 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top1Q04750 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Top1Q04750 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top1Q04750 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top1Q04750 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top1Q04750 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Top1Q04750 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Top1Q04750 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Top1Q04750 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Top1Q04750 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Top1Q04750 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Top1Q04750 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms