Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Crisp3Q03402 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Crisp3Q03402 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Crisp3Q03402 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms