Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Thbs2Q03350 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Thbs2Q03350 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms