Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Htr1fQ02284 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Htr1fQ02284 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Htr1fQ02284 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Htr1fQ02284 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Htr1fQ02284 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Htr1fQ02284 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Htr1fQ02284 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Htr1fQ02284 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Htr1fQ02284 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Htr1fQ02284 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Htr1fQ02284 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Htr1fQ02284 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Htr1fQ02284 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Htr1fQ02284 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Htr1fQ02284 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Htr1fQ02284 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Htr1fQ02284 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Htr1fQ02284 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Htr1fQ02284 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Htr1fQ02284 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Htr1fQ02284 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms