Protein–RNA interactions for Protein: Q00417

Tcf7, Transcription factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7Q00417 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcf7Q00417 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcf7Q00417 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcf7Q00417 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcf7Q00417 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Tcf7Q00417 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcf7Q00417 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcf7Q00417 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcf7Q00417 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcf7Q00417 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcf7Q00417 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcf7Q00417 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tcf7Q00417 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcf7Q00417 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tcf7Q00417 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tcf7Q00417 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tcf7Q00417 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tcf7Q00417 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcf7Q00417 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcf7Q00417 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcf7Q00417 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcf7Q00417 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcf7Q00417 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcf7Q00417 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcf7Q00417 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcf7Q00417 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcf7Q00417 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcf7Q00417 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tcf7Q00417 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tcf7Q00417 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tcf7Q00417 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcf7Q00417 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcf7Q00417 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcf7Q00417 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tcf7Q00417 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tcf7Q00417 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tcf7Q00417 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tcf7Q00417 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tcf7Q00417 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tcf7Q00417 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tcf7Q00417 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tcf7Q00417 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcf7Q00417 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcf7Q00417 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcf7Q00417 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcf7Q00417 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcf7Q00417 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tcf7Q00417 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms