Protein–RNA interactions for Protein: P98084

Apba2, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 2, mousemouse

Predictions only

Length 750 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba2P98084 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Apba2P98084 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Apba2P98084 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Apba2P98084 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Apba2P98084 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Apba2P98084 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Apba2P98084 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Apba2P98084 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Apba2P98084 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Apba2P98084 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Apba2P98084 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Apba2P98084 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Apba2P98084 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Apba2P98084 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Apba2P98084 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Apba2P98084 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Apba2P98084 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Apba2P98084 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Apba2P98084 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Apba2P98084 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Apba2P98084 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Apba2P98084 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Apba2P98084 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Apba2P98084 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Apba2P98084 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Apba2P98084 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Apba2P98084 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Apba2P98084 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Apba2P98084 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Apba2P98084 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Apba2P98084 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Apba2P98084 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Apba2P98084 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Apba2P98084 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Apba2P98084 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Apba2P98084 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Apba2P98084 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Apba2P98084 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Apba2P98084 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Apba2P98084 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Apba2P98084 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Apba2P98084 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Apba2P98084 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Apba2P98084 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Apba2P98084 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Apba2P98084 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Apba2P98084 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Apba2P98084 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Apba2P98084 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Apba2P98084 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Apba2P98084 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Apba2P98084 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Apba2P98084 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Apba2P98084 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Apba2P98084 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Apba2P98084 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Apba2P98084 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Apba2P98084 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Apba2P98084 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Apba2P98084 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Apba2P98084 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Apba2P98084 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Apba2P98084 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Apba2P98084 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Apba2P98084 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Apba2P98084 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Apba2P98084 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Apba2P98084 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Apba2P98084 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Apba2P98084 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Apba2P98084 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Apba2P98084 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Apba2P98084 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Apba2P98084 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Apba2P98084 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Apba2P98084 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Apba2P98084 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Apba2P98084 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Apba2P98084 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Apba2P98084 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Apba2P98084 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Apba2P98084 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Apba2P98084 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Apba2P98084 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Apba2P98084 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Apba2P98084 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Apba2P98084 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Apba2P98084 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Apba2P98084 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Apba2P98084 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Apba2P98084 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Apba2P98084 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Apba2P98084 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Apba2P98084 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Apba2P98084 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Apba2P98084 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Apba2P98084 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Apba2P98084 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Apba2P98084 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Apba2P98084 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms