Protein–RNA interactions for Protein: P97785

Gfra1, GDNF family receptor alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra1P97785 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Gfra1P97785 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gfra1P97785 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms