Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tubg1P83887 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tubg1P83887 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tubg1P83887 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms