Protein–RNA interactions for Protein: P62915

Gtf2b, Transcription initiation factor IIB, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2bP62915 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2bP62915 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gtf2bP62915 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2bP62915 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2bP62915 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gtf2bP62915 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2bP62915 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2bP62915 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2bP62915 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2bP62915 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2bP62915 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2bP62915 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gtf2bP62915 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2bP62915 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2bP62915 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2bP62915 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2bP62915 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2bP62915 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2bP62915 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2bP62915 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2bP62915 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gtf2bP62915 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2bP62915 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gtf2bP62915 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2bP62915 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2bP62915 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gtf2bP62915 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2bP62915 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gtf2bP62915 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2bP62915 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2bP62915 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gtf2bP62915 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2bP62915 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2bP62915 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2bP62915 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gtf2bP62915 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf2bP62915 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf2bP62915 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf2bP62915 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf2bP62915 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gtf2bP62915 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gtf2bP62915 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gtf2bP62915 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.9 ms