Protein–RNA interactions for Protein: P60603

Romo1, Reactive oxygen species modulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Romo1P60603 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Romo1P60603 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Romo1P60603 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Romo1P60603 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Romo1P60603 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Romo1P60603 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Romo1P60603 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms