Protein–RNA interactions for Protein: P60229

Eif3e, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3eP60229 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif3eP60229 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif3eP60229 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Eif3eP60229 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif3eP60229 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Eif3eP60229 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Eif3eP60229 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3eP60229 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3eP60229 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3eP60229 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3eP60229 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Eif3eP60229 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif3eP60229 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif3eP60229 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Eif3eP60229 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Eif3eP60229 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eif3eP60229 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eif3eP60229 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eif3eP60229 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Eif3eP60229 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif3eP60229 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif3eP60229 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif3eP60229 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif3eP60229 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Eif3eP60229 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif3eP60229 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif3eP60229 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif3eP60229 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif3eP60229 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif3eP60229 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif3eP60229 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif3eP60229 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif3eP60229 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Eif3eP60229 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eif3eP60229 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eif3eP60229 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Eif3eP60229 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Eif3eP60229 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Eif3eP60229 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Eif3eP60229 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif3eP60229 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif3eP60229 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif3eP60229 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif3eP60229 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif3eP60229 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif3eP60229 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Eif3eP60229 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Eif3eP60229 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Eif3eP60229 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Eif3eP60229 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Eif3eP60229 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Eif3eP60229 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Eif3eP60229 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Eif3eP60229 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Eif3eP60229 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eif3eP60229 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eif3eP60229 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eif3eP60229 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Eif3eP60229 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Eif3eP60229 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.1 ms