Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Nphp4P59240 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Nphp4P59240 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Nphp4P59240 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Nphp4P59240 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Nphp4P59240 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Nphp4P59240 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Nphp4P59240 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nphp4P59240 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nphp4P59240 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nphp4P59240 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nphp4P59240 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nphp4P59240 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Nphp4P59240 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nphp4P59240 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nphp4P59240 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nphp4P59240 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nphp4P59240 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nphp4P59240 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nphp4P59240 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Nphp4P59240 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Nphp4P59240 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Nphp4P59240 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Nphp4P59240 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Nphp4P59240 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Nphp4P59240 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Nphp4P59240 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nphp4P59240 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Nphp4P59240 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Nphp4P59240 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Nphp4P59240 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Nphp4P59240 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Nphp4P59240 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Nphp4P59240 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Nphp4P59240 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nphp4P59240 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nphp4P59240 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Nphp4P59240 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nphp4P59240 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Nphp4P59240 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nphp4P59240 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nphp4P59240 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Nphp4P59240 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nphp4P59240 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nphp4P59240 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nphp4P59240 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nphp4P59240 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nphp4P59240 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Nphp4P59240 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Nphp4P59240 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Nphp4P59240 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Nphp4P59240 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Nphp4P59240 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Nphp4P59240 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Nphp4P59240 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Nphp4P59240 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nphp4P59240 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nphp4P59240 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Nphp4P59240 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nphp4P59240 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nphp4P59240 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nphp4P59240 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Nphp4P59240 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nphp4P59240 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nphp4P59240 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nphp4P59240 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Nphp4P59240 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nphp4P59240 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nphp4P59240 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nphp4P59240 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nphp4P59240 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Nphp4P59240 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nphp4P59240 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nphp4P59240 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nphp4P59240 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nphp4P59240 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Nphp4P59240 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Nphp4P59240 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Nphp4P59240 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nphp4P59240 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nphp4P59240 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Nphp4P59240 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nphp4P59240 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nphp4P59240 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nphp4P59240 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Nphp4P59240 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nphp4P59240 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nphp4P59240 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nphp4P59240 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Nphp4P59240 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nphp4P59240 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Nphp4P59240 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Nphp4P59240 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nphp4P59240 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nphp4P59240 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nphp4P59240 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nphp4P59240 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nphp4P59240 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nphp4P59240 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Nphp4P59240 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms