Protein–RNA interactions for Protein: P59114

Pcif1, Phosphorylated CTD-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcif1P59114 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pcif1P59114 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pcif1P59114 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcif1P59114 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcif1P59114 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcif1P59114 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcif1P59114 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pcif1P59114 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcif1P59114 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcif1P59114 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcif1P59114 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcif1P59114 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcif1P59114 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcif1P59114 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pcif1P59114 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcif1P59114 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcif1P59114 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcif1P59114 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcif1P59114 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pcif1P59114 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcif1P59114 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcif1P59114 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcif1P59114 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pcif1P59114 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcif1P59114 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcif1P59114 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcif1P59114 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcif1P59114 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcif1P59114 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pcif1P59114 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcif1P59114 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcif1P59114 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcif1P59114 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcif1P59114 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcif1P59114 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pcif1P59114 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pcif1P59114 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms