Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pdcd5P56812 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Pdcd5P56812 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Pdcd5P56812 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms