Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rad23bP54728 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rad23bP54728 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rad23bP54728 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rad23bP54728 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rad23bP54728 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rad23bP54728 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rad23bP54728 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rad23bP54728 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rad23bP54728 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rad23bP54728 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rad23bP54728 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rad23bP54728 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rad23bP54728 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rad23bP54728 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Rad23bP54728 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rad23bP54728 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rad23bP54728 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rad23bP54728 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rad23bP54728 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rad23bP54728 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rad23bP54728 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rad23bP54728 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rad23bP54728 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rad23bP54728 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rad23bP54728 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rad23bP54728 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rad23bP54728 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rad23bP54728 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rad23bP54728 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rad23bP54728 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rad23bP54728 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Rad23bP54728 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rad23bP54728 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rad23bP54728 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rad23bP54728 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rad23bP54728 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rad23bP54728 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rad23bP54728 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rad23bP54728 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Rad23bP54728 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Rad23bP54728 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rad23bP54728 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rad23bP54728 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rad23bP54728 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Rad23bP54728 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms