Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Cux1P53564 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
Cux1P53564 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cux1P53564 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cux1P53564 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cux1P53564 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cux1P53564 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cux1P53564 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Cux1P53564 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cux1P53564 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Cux1P53564 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cux1P53564 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cux1P53564 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cux1P53564 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Cux1P53564 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cux1P53564 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cux1P53564 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Cux1P53564 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Cux1P53564 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cux1P53564 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cux1P53564 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cux1P53564 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Cux1P53564 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cux1P53564 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cux1P53564 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Cux1P53564 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cux1P53564 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cux1P53564 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cux1P53564 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cux1P53564 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cux1P53564 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Cux1P53564 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cux1P53564 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cux1P53564 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Cux1P53564 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Cux1P53564 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cux1P53564 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Cux1P53564 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Cux1P53564 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cux1P53564 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Cux1P53564 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Cux1P53564 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cux1P53564 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cux1P53564 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Cux1P53564 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cux1P53564 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Cux1P53564 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Cux1P53564 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cux1P53564 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cux1P53564 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Cux1P53564 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Cux1P53564 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Cux1P53564 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
Cux1P53564 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Cux1P53564 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Cux1P53564 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Cux1P53564 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cux1P53564 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Cux1P53564 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cux1P53564 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cux1P53564 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC33.79■■■■□ 3
Cux1P53564 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Cux1P53564 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cux1P53564 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Cux1P53564 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Cux1P53564 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
Cux1P53564 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Cux1P53564 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Cux1P53564 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Cux1P53564 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cux1P53564 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cux1P53564 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Cux1P53564 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cux1P53564 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cux1P53564 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Cux1P53564 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Cux1P53564 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Cux1P53564 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cux1P53564 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Cux1P53564 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cux1P53564 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cux1P53564 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cux1P53564 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cux1P53564 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cux1P53564 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Cux1P53564 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cux1P53564 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cux1P53564 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Cux1P53564 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Cux1P53564 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Cux1P53564 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cux1P53564 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cux1P53564 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cux1P53564 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cux1P53564 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cux1P53564 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cux1P53564 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cux1P53564 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
Cux1P53564 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cux1P53564 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms