Protein–RNA interactions for Protein: P51943

Ccna2, Cyclin-A2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccna2P51943 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccna2P51943 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccna2P51943 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccna2P51943 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccna2P51943 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccna2P51943 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccna2P51943 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccna2P51943 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms