Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmod1P49813 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmod1P49813 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tmod1P49813 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmod1P49813 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmod1P49813 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmod1P49813 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmod1P49813 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmod1P49813 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmod1P49813 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmod1P49813 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tmod1P49813 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tmod1P49813 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tmod1P49813 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tmod1P49813 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tmod1P49813 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms