Protein–RNA interactions for Protein: P49135

Ercc3, General transcription and DNA repair factor IIH helicase subunit XPB, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc3P49135 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Ercc3P49135 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ercc3P49135 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ercc3P49135 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ercc3P49135 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ercc3P49135 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ercc3P49135 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ercc3P49135 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ercc3P49135 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ercc3P49135 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ercc3P49135 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ercc3P49135 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ercc3P49135 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ercc3P49135 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ercc3P49135 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ercc3P49135 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ercc3P49135 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Ercc3P49135 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ercc3P49135 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ercc3P49135 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc3P49135 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc3P49135 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc3P49135 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc3P49135 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ercc3P49135 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ercc3P49135 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ercc3P49135 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ercc3P49135 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ercc3P49135 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ercc3P49135 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ercc3P49135 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ercc3P49135 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ercc3P49135 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ercc3P49135 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ercc3P49135 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ercc3P49135 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ercc3P49135 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ercc3P49135 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ercc3P49135 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ercc3P49135 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ercc3P49135 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ercc3P49135 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ercc3P49135 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ercc3P49135 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ercc3P49135 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ercc3P49135 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ercc3P49135 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ercc3P49135 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ercc3P49135 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ercc3P49135 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ercc3P49135 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ercc3P49135 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ercc3P49135 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ercc3P49135 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ercc3P49135 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ercc3P49135 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ercc3P49135 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ercc3P49135 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ercc3P49135 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms