Protein–RNA interactions for Protein: P48193

Epb41, Protein 4.1, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41P48193 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Epb41P48193 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Epb41P48193 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Epb41P48193 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Epb41P48193 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Epb41P48193 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Epb41P48193 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Epb41P48193 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Epb41P48193 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Epb41P48193 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Epb41P48193 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Epb41P48193 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Epb41P48193 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Epb41P48193 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Epb41P48193 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Epb41P48193 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Epb41P48193 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Epb41P48193 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Epb41P48193 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Epb41P48193 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Epb41P48193 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Epb41P48193 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Epb41P48193 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Epb41P48193 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Epb41P48193 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Epb41P48193 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epb41P48193 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epb41P48193 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epb41P48193 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epb41P48193 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epb41P48193 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epb41P48193 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epb41P48193 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Epb41P48193 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epb41P48193 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Epb41P48193 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Epb41P48193 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Epb41P48193 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Epb41P48193 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Epb41P48193 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Epb41P48193 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Epb41P48193 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Epb41P48193 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Epb41P48193 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms