Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdkn1bP46414 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Cdkn1bP46414 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdkn1bP46414 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms