Protein–RNA interactions for Protein: P43006

Slc1a2, Excitatory amino acid transporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a2P43006 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc1a2P43006 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc1a2P43006 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc1a2P43006 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms