Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Nkx1-2P42580 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nkx1-2P42580 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nkx1-2P42580 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nkx1-2P42580 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nkx1-2P42580 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nkx1-2P42580 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nkx1-2P42580 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nkx1-2P42580 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nkx1-2P42580 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nkx1-2P42580 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nkx1-2P42580 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Nkx1-2P42580 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nkx1-2P42580 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nkx1-2P42580 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Nkx1-2P42580 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nkx1-2P42580 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nkx1-2P42580 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nkx1-2P42580 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Nkx1-2P42580 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nkx1-2P42580 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Nkx1-2P42580 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Nkx1-2P42580 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nkx1-2P42580 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nkx1-2P42580 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Nkx1-2P42580 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nkx1-2P42580 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Nkx1-2P42580 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nkx1-2P42580 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nkx1-2P42580 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nkx1-2P42580 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Nkx1-2P42580 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nkx1-2P42580 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Nkx1-2P42580 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Nkx1-2P42580 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nkx1-2P42580 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nkx1-2P42580 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nkx1-2P42580 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nkx1-2P42580 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nkx1-2P42580 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Nkx1-2P42580 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nkx1-2P42580 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nkx1-2P42580 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nkx1-2P42580 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nkx1-2P42580 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nkx1-2P42580 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nkx1-2P42580 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Nkx1-2P42580 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nkx1-2P42580 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nkx1-2P42580 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nkx1-2P42580 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nkx1-2P42580 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Nkx1-2P42580 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nkx1-2P42580 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nkx1-2P42580 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nkx1-2P42580 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Nkx1-2P42580 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nkx1-2P42580 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nkx1-2P42580 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nkx1-2P42580 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nkx1-2P42580 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Nkx1-2P42580 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nkx1-2P42580 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nkx1-2P42580 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nkx1-2P42580 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Nkx1-2P42580 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Nkx1-2P42580 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Nkx1-2P42580 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Nkx1-2P42580 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nkx1-2P42580 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nkx1-2P42580 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nkx1-2P42580 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nkx1-2P42580 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Nkx1-2P42580 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nkx1-2P42580 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nkx1-2P42580 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nkx1-2P42580 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nkx1-2P42580 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nkx1-2P42580 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nkx1-2P42580 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Nkx1-2P42580 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms