Protein–RNA interactions for Protein: P35459

Ly6d, Lymphocyte antigen 6D, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6dP35459 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ly6dP35459 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ly6dP35459 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ly6dP35459 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ly6dP35459 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ly6dP35459 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ly6dP35459 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ly6dP35459 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ly6dP35459 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ly6dP35459 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ly6dP35459 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ly6dP35459 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ly6dP35459 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ly6dP35459 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ly6dP35459 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ly6dP35459 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ly6dP35459 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ly6dP35459 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ly6dP35459 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ly6dP35459 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ly6dP35459 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ly6dP35459 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ly6dP35459 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ly6dP35459 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ly6dP35459 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ly6dP35459 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ly6dP35459 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ly6dP35459 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ly6dP35459 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ly6dP35459 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ly6dP35459 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ly6dP35459 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ly6dP35459 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ly6dP35459 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ly6dP35459 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ly6dP35459 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ly6dP35459 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ly6dP35459 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Ly6dP35459 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ly6dP35459 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ly6dP35459 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ly6dP35459 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ly6dP35459 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ly6dP35459 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ly6dP35459 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ly6dP35459 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ly6dP35459 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ly6dP35459 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ly6dP35459 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ly6dP35459 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ly6dP35459 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ly6dP35459 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ly6dP35459 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ly6dP35459 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ly6dP35459 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ly6dP35459 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ly6dP35459 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ly6dP35459 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ly6dP35459 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms