Protein–RNA interactions for Protein: P35282

Rab21, Ras-related protein Rab-21, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab21P35282 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab21P35282 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab21P35282 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rab21P35282 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab21P35282 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rab21P35282 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab21P35282 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab21P35282 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab21P35282 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab21P35282 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab21P35282 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab21P35282 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab21P35282 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab21P35282 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab21P35282 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rab21P35282 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab21P35282 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab21P35282 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab21P35282 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab21P35282 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab21P35282 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab21P35282 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab21P35282 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab21P35282 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab21P35282 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab21P35282 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab21P35282 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab21P35282 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab21P35282 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab21P35282 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab21P35282 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab21P35282 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab21P35282 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab21P35282 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab21P35282 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rab21P35282 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Rab21P35282 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab21P35282 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab21P35282 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab21P35282 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab21P35282 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab21P35282 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab21P35282 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rab21P35282 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab21P35282 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab21P35282 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab21P35282 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab21P35282 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Rab21P35282 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab21P35282 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab21P35282 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rab21P35282 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab21P35282 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab21P35282 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab21P35282 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab21P35282 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab21P35282 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab21P35282 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab21P35282 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab21P35282 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab21P35282 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rab21P35282 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab21P35282 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rab21P35282 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms