Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Hoxc11P31313 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxc11P31313 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxc11P31313 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Hoxc11P31313 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxc11P31313 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Hoxc11P31313 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxc11P31313 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxc11P31313 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxc11P31313 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxc11P31313 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxc11P31313 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxc11P31313 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxc11P31313 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxc11P31313 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Hoxc11P31313 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxc11P31313 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Hoxc11P31313 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxc11P31313 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxc11P31313 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxc11P31313 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxc11P31313 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxc11P31313 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Hoxc11P31313 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxc11P31313 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxc11P31313 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxc11P31313 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxc11P31313 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxc11P31313 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Hoxc11P31313 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hoxc11P31313 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hoxc11P31313 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hoxc11P31313 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxc11P31313 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms