Protein–RNA interactions for Protein: P31311

Hoxa11, Homeobox protein Hox-A11, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa11P31311 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxa11P31311 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hoxa11P31311 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxa11P31311 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hoxa11P31311 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Hoxa11P31311 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxa11P31311 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxa11P31311 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxa11P31311 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxa11P31311 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxa11P31311 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxa11P31311 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxa11P31311 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxa11P31311 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxa11P31311 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxa11P31311 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxa11P31311 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxa11P31311 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxa11P31311 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxa11P31311 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxa11P31311 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxa11P31311 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxa11P31311 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxa11P31311 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxa11P31311 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxa11P31311 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxa11P31311 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxa11P31311 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxa11P31311 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxa11P31311 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxa11P31311 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxa11P31311 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxa11P31311 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxa11P31311 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxa11P31311 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxa11P31311 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxa11P31311 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxa11P31311 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms