Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Hoxa10P31310 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Hoxa10P31310 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Hoxa10P31310 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms