Protein–RNA interactions for Protein: P30280

Ccnd2, G1/S-specific cyclin-D2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd2P30280 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccnd2P30280 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccnd2P30280 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccnd2P30280 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccnd2P30280 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccnd2P30280 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccnd2P30280 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccnd2P30280 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccnd2P30280 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccnd2P30280 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccnd2P30280 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccnd2P30280 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccnd2P30280 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccnd2P30280 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccnd2P30280 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccnd2P30280 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccnd2P30280 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccnd2P30280 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnd2P30280 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnd2P30280 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnd2P30280 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnd2P30280 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnd2P30280 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccnd2P30280 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccnd2P30280 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccnd2P30280 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccnd2P30280 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccnd2P30280 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccnd2P30280 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccnd2P30280 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccnd2P30280 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccnd2P30280 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccnd2P30280 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccnd2P30280 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccnd2P30280 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccnd2P30280 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccnd2P30280 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccnd2P30280 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccnd2P30280 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccnd2P30280 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ccnd2P30280 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccnd2P30280 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccnd2P30280 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccnd2P30280 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccnd2P30280 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccnd2P30280 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccnd2P30280 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccnd2P30280 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccnd2P30280 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccnd2P30280 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccnd2P30280 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccnd2P30280 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccnd2P30280 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccnd2P30280 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccnd2P30280 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccnd2P30280 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccnd2P30280 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ccnd2P30280 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnd2P30280 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccnd2P30280 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms