Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp2P29594 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp2P29594 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp2P29594 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp2P29594 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp2P29594 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp2P29594 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp2P29594 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp2P29594 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp2P29594 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp2P29594 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Casp2P29594 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Casp2P29594 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp2P29594 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp2P29594 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp2P29594 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Casp2P29594 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Casp2P29594 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp2P29594 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp2P29594 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casp2P29594 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casp2P29594 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Casp2P29594 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms