Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PtprmP28828 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PtprmP28828 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PtprmP28828 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
PtprmP28828 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PtprmP28828 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PtprmP28828 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PtprmP28828 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PtprmP28828 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
PtprmP28828 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
PtprmP28828 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PtprmP28828 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PtprmP28828 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PtprmP28828 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
PtprmP28828 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PtprmP28828 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
PtprmP28828 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PtprmP28828 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PtprmP28828 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PtprmP28828 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PtprmP28828 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
PtprmP28828 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
PtprmP28828 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PtprmP28828 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
PtprmP28828 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PtprmP28828 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PtprmP28828 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PtprmP28828 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PtprmP28828 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PtprmP28828 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PtprmP28828 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PtprmP28828 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
PtprmP28828 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PtprmP28828 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PtprmP28828 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PtprmP28828 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PtprmP28828 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PtprmP28828 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PtprmP28828 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PtprmP28828 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
PtprmP28828 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PtprmP28828 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PtprmP28828 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PtprmP28828 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PtprmP28828 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
PtprmP28828 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PtprmP28828 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
PtprmP28828 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PtprmP28828 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PtprmP28828 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
PtprmP28828 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PtprmP28828 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PtprmP28828 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PtprmP28828 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PtprmP28828 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PtprmP28828 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PtprmP28828 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PtprmP28828 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PtprmP28828 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PtprmP28828 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PtprmP28828 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PtprmP28828 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PtprmP28828 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PtprmP28828 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PtprmP28828 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PtprmP28828 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PtprmP28828 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PtprmP28828 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PtprmP28828 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PtprmP28828 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
PtprmP28828 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PtprmP28828 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
PtprmP28828 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
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