Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Slc6a9P28571 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Slc6a9P28571 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc6a9P28571 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc6a9P28571 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Slc6a9P28571 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc6a9P28571 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Slc6a9P28571 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc6a9P28571 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc6a9P28571 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc6a9P28571 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc6a9P28571 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc6a9P28571 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc6a9P28571 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc6a9P28571 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc6a9P28571 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Slc6a9P28571 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc6a9P28571 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc6a9P28571 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc6a9P28571 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc6a9P28571 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc6a9P28571 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc6a9P28571 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc6a9P28571 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc6a9P28571 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc6a9P28571 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc6a9P28571 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc6a9P28571 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Slc6a9P28571 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms