Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Hoxd10P28359 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Hoxd10P28359 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Hoxd10P28359 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxd10P28359 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxd10P28359 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxd10P28359 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxd10P28359 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxd10P28359 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxd10P28359 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxd10P28359 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxd10P28359 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxd10P28359 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxd10P28359 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxd10P28359 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxd10P28359 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxd10P28359 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxd10P28359 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxd10P28359 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxd10P28359 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxd10P28359 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxd10P28359 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxd10P28359 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxd10P28359 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxd10P28359 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxd10P28359 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxd10P28359 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxd10P28359 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxd10P28359 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxd10P28359 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxd10P28359 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxd10P28359 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxd10P28359 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxd10P28359 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxd10P28359 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxd10P28359 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxd10P28359 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxd10P28359 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxd10P28359 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxd10P28359 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxd10P28359 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxd10P28359 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxd10P28359 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxd10P28359 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxd10P28359 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxd10P28359 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxd10P28359 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxd10P28359 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxd10P28359 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxd10P28359 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxd10P28359 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxd10P28359 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxd10P28359 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxd10P28359 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxd10P28359 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.9 ms