Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2afxP27661 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2afxP27661 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2afxP27661 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2afxP27661 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2afxP27661 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
H2afxP27661 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2afxP27661 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2afxP27661 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2afxP27661 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2afxP27661 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
H2afxP27661 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2afxP27661 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2afxP27661 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
H2afxP27661 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
H2afxP27661 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2afxP27661 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2afxP27661 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2afxP27661 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2afxP27661 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2afxP27661 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
H2afxP27661 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2afxP27661 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
H2afxP27661 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2afxP27661 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2afxP27661 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2afxP27661 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2afxP27661 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
H2afxP27661 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2afxP27661 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2afxP27661 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
H2afxP27661 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2afxP27661 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2afxP27661 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2afxP27661 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2afxP27661 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
H2afxP27661 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2afxP27661 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2afxP27661 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
H2afxP27661 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2afxP27661 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2afxP27661 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2afxP27661 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2afxP27661 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
H2afxP27661 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2afxP27661 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2afxP27661 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2afxP27661 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2afxP27661 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2afxP27661 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2afxP27661 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2afxP27661 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2afxP27661 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2afxP27661 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
H2afxP27661 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2afxP27661 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2afxP27661 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2afxP27661 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2afxP27661 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
H2afxP27661 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
H2afxP27661 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2afxP27661 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2afxP27661 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2afxP27661 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
H2afxP27661 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
H2afxP27661 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2afxP27661 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
H2afxP27661 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms