Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tnnc2P20801 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnnc2P20801 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnnc2P20801 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.5 ms