Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RargP18911 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RargP18911 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RargP18911 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RargP18911 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RargP18911 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RargP18911 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RargP18911 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RargP18911 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RargP18911 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RargP18911 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RargP18911 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RargP18911 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RargP18911 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RargP18911 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RargP18911 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RargP18911 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RargP18911 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RargP18911 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RargP18911 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RargP18911 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RargP18911 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RargP18911 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RargP18911 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RargP18911 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RargP18911 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RargP18911 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RargP18911 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RargP18911 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RargP18911 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RargP18911 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RargP18911 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RargP18911 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RargP18911 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RargP18911 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RargP18911 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RargP18911 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RargP18911 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RargP18911 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RargP18911 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RargP18911 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RargP18911 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RargP18911 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RargP18911 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RargP18911 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RargP18911 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RargP18911 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RargP18911 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RargP18911 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RargP18911 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RargP18911 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RargP18911 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RargP18911 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RargP18911 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RargP18911 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RargP18911 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RargP18911 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RargP18911 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RargP18911 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RargP18911 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RargP18911 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RargP18911 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RargP18911 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RargP18911 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RargP18911 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RargP18911 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RargP18911 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RargP18911 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RargP18911 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RargP18911 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RargP18911 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RargP18911 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RargP18911 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RargP18911 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RargP18911 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RargP18911 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RargP18911 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RargP18911 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RargP18911 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RargP18911 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RargP18911 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RargP18911 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RargP18911 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RargP18911 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RargP18911 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RargP18911 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RargP18911 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RargP18911 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RargP18911 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RargP18911 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RargP18911 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RargP18911 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RargP18911 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RargP18911 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RargP18911 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RargP18911 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RargP18911 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RargP18911 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RargP18911 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RargP18911 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms